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Pagina del proyecto:http://drugdiscoveryathome.com/

Pagina Boinc:http://boinc.drugdiscoveryathome.com/index.php

Pagina equipo:http://boinc.drugdiscoveryathome.com/team_display.php?teamid=501

Plataforma de trabajo:Windows-Linux y Mac.

Datos temporales de unidades de trabajo a dia de hoy:

RAM: 58MB
Duración: 30min
Deadline: 5 días



Nuestra misión es diseñar y probar las drogas como posibles compuestos para la regulación de las vías implicadas en la ingeniería de tejidos y en el cáncer


Las principales diferencias de nuestro proyecto de otros proyectos de computacion distribuida

Nuestros Objetivos

1)En primer lugar:La principal diferencia es el ámbito de la investigación. Nuestro proyecto es el primer proyecto dedicado a los estudios de la estructuras moleculares y diseño de fármacos ,hechos por simulación computacional de proteínas, y que en la biología participan las células madre.
En lo que respecta a la biología de las células madre están relacionadas con la investigación sobre el cáncer ,la segunda área de nuestro interés es el cáncer. El principal objetivo de nuestra investigación es el descubrimiento de fármacos para encontrar las drogas para combatirlo, como los compuestos que pueden ser utilizados en las células madre y medicina regenerativa ,basada en el trasplante de celulas somaticas . Así que lo primero, y lo principal es diferenciar el objetivo del proyecto.

2) La investigación fundamental sobre la estructura y plegamiento de proteínas no son los principales objetivos del proyecto. El conocimiento sobre la estructura de la proteína función y los mecanismos para nosotros es sólo el primer paso hacia las simulaciones drogas de diseño en simulaciones computacionales de compuestos de moléculas pequeñas, que actúan sobre estos objetivos biológicos. Por supuesto esperamos perfeccionar algunas proteínas interesantes y estructuras espaciales y tal vez hacer algunas reflexiones en algunos mecanismos de las funciones de las proteínas, pero esto es sólo el primer paso.

El segundo paso es el descubrimiento de medicamentos basado en la pantalla virtual flexible para la bases de datos disponibles de compuestos orgánicos. La mayoría de los posibles compuestos organicos son para evaluar un plan de modo vinculante con objetivos de vida por su uso de alto rendimiento de dinámica molecular.


3) Tenemos previsto reunir a todos los proyectos destinados a la simulacion computacional en el descubrimiento de medicamentos hechos , incluidos los métodos de modelado de la estructura de la proteína, la identificación y el éxito post-procesamiento de los resultados por métodos QSAR. Algunos se utilizan como aplicaciones de informática distribuida (como GROMACS y Autodock) y algunos se utilizan como aplicaciones fuera de línea. También queremos evaluar el poder predictivo de los métodos basados en el descubrimiento de analizaje de fármacos. Así que el plan para obtener los datos de diversidad, centrado en compuestos orgánicos destinados a ensayos biológicos ,como el principal objetivo del proyecto.

4) El objetivo principal de este proyecto es no sólo para hacer trabajos científicos sobre aspectos fundamentales de la proteína y hacer algunas funciones de ordenador de investigación, pero el desarrollo de simulacion computacional de la transferencia de resultados de ensayos biológicos para la optimización de resultados identificados.

ANTECEDENTES DEL PROYECTO DE INVESTIGACIÓN

En primer lugar, estamos buscando compuestos que puedan ser utilizados para el arreglo de las actividades de las células madre adultas(Tallos Nicho) esta seccion en las células madre adultas se encuentran en todo el cuerpo humano. Estos nichos están muy extendidas en la mayoría de los tejidos (puede ser la hipótesis de que en todos los tejidos) en las personas mayores como en los más jóvenes (pero en menor medida, en las ancianas). Estos son parte de las células madre, que participaron en el desarrollo embrionario y, a continuación, se detuvieron la regeneración de nuevos tejidos , se frenaron y se desperto un estado vegetativo el momento en que algunos tejidos den señales de Tallos Nicho.


La división incontrolada de esas células madre conduce a la transformación y el cáncer maligno. Por otra, el cuerpo humano tiene los mecanismos de control para que se derivan las células madre en nichos para evitar la utilización directa de las células madre en la terapia regenerativa . Por lo tanto, nuestra hipótesis es que el ajustado equilibrio entre la regulación de la actividad regeneradora de las células madre y el cáncer pueden ser alcanzado por una norma específica de los factores de crecimiento y proteínas , la regulación de las actividades de las células madre en el tallo nichos.

Según nuestra hipótesis, tales ajustes se puede utilizar para el tratamiento de diversos tipos de cáncer y para la inducción de la regeneración de los diferentes tipos de tejidos, incluso en los organismos viejos. La primera proteína de los candidatos a dicha reglamentación : Wnt / Frizzled, Shh / Smoothened y Muesca.
Los próximos objetivos son, por supuesto, decenas de factores relacionados con el crecimiento.

CARTOGRAFIA Y SISTEMA DE BIOLOGÍA

Para afinar las actividades de las células madre en el tallo nichos mencionados anteriormente es una tarea complicada, en relación con la cartografía de las rutas correctas. Así que una de nuestras tareas es la de hacer una línea con el servidor y mapas interactivos ,el resultado del sistema de la biología de análisis de datos. Esto no está relacionada con la computacion distribuida, pero también está previsto para ser parte de nuestro proyecto.

Asimismo, hay partes que con la computación distribuida no tenemos previsto hacer el desarrollo de varias aplicaciones de diseño de fármacos asistido por ordenador.



Grafica Superior:Esta es una simplificación del proyecto .
La primera parte de nuestro proyecto es el modelado molecular de la estructura espacial de los principales participantes
La segunda parte está dedicada a los ensayos biológicos en simulacional computacional y optimización. La otra parte del proyecto es la cartografía dedicada a la comprensión de los mapas que provienen Tallos nichos y la regulación de los diferentes tipos de tejidos , la comprensión de la intersección de mapas y la actividad de las células madre y las rutas de actividad de las células del cáncer.

Traducido por Efren de la web drugdiscoveryathome en colaboracion Mr Boinc con TitanesDC